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Os sinalizadores (flags) definidos na variável USE definem quais funcionalidades são ativadas quando os pacotes são construídos. Não é recomendado adicionar muitos sinalizadores USE durante a instalação; você deve esperar até ter um sistema inicializável funcional antes de alterar seus flags em USE. Um sinalizador de USE prefixado com um sinal de menos ("-") diz ao Portage para não usar esse sinalizador durante a compilação. Um guia do Funtoo para as flags USE estará disponível no futuro. Por enquanto, você pode encontrar mais informações sobre as opções de USE no Manual do Gentoo em Gentoo Handbook.